MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A

Total Repeats: 61311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021826	TGA	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888609
2	NC_021826	GTT	2	6	840	845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888609
3	NC_021826	A	7	7	956	962	100 %	0 %	0 %	0 %	525888610
4	NC_021826	TAA	2	6	970	975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888610
5	NC_021826	AGA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888610
6	NC_021826	TAT	2	6	1004	1009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888610
7	NC_021826	TCT	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888610
8	NC_021826	TAA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888610
9	NC_021826	ATC	2	6	1772	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888611
10	NC_021826	TGT	2	6	1821	1826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888611
11	NC_021826	T	7	7	1832	1838	0 %	100 %	0 %	0 %	525888611
12	NC_021826	TTC	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888611
13	NC_021826	ATT	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
14	NC_021826	TTA	2	6	1977	1982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
15	NC_021826	A	8	8	1994	2001	100 %	0 %	0 %	0 %	525888611
16	NC_021826	TTA	2	6	2010	2015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
17	NC_021826	TGT	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888611
18	NC_021826	T	7	7	2070	2076	0 %	100 %	0 %	0 %	525888611
19	NC_021826	GTG	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525888611
20	NC_021826	TTC	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888611
21	NC_021826	ATGT	2	8	2146	2153	25 %	50 %	25 %	0 %	525888611
22	NC_021826	TG	3	6	2208	2213	0 %	50 %	50 %	0 %	525888611
23	NC_021826	T	7	7	2273	2279	0 %	100 %	0 %	0 %	525888611
24	NC_021826	T	7	7	2344	2350	0 %	100 %	0 %	0 %	525888611
25	NC_021826	CCT	2	6	2404	2409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525888611
26	NC_021826	TTA	2	6	2497	2502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888611
27	NC_021826	CCA	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525888611
28	NC_021826	CAT	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888611
29	NC_021826	GTT	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525888611
30	NC_021826	T	6	6	2609	2614	0 %	100 %	0 %	0 %	525888611
31	NC_021826	CACCC	2	10	2615	2624	20 %	0 %	0 %	80 %	525888611
32	NC_021826	A	7	7	3339	3345	100 %	0 %	0 %	0 %	525888612
33	NC_021826	AAAAT	2	10	3383	3392	80 %	20 %	0 %	0 %	525888612
34	NC_021826	GAA	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888612
35	NC_021826	TCA	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888612
36	NC_021826	AAG	2	6	3467	3472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888612
37	NC_021826	GAG	2	6	3479	3484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525888612
38	NC_021826	AGA	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888612
39	NC_021826	AAT	2	6	3580	3585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888612
40	NC_021826	A	7	7	3590	3596	100 %	0 %	0 %	0 %	525888612
41	NC_021826	ACA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525888612
42	NC_021826	AAC	2	6	3709	3714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525888613
43	NC_021826	TGAATA	2	12	3731	3742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525888613
44	NC_021826	TAC	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888613
45	NC_021826	ATG	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888613
46	NC_021826	GAA	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888613
47	NC_021826	AAT	2	6	3841	3846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888614
48	NC_021826	A	7	7	3851	3857	100 %	0 %	0 %	0 %	525888614
49	NC_021826	CTA	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888614
50	NC_021826	GTAA	2	8	3968	3975	50 %	25 %	25 %	0 %	525888614
51	NC_021826	GAA	2	6	3995	4000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888614
52	NC_021826	TGGA	2	8	4018	4025	25 %	25 %	50 %	0 %	525888614
53	NC_021826	AAG	2	6	4036	4041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888614
54	NC_021826	ATA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888614
55	NC_021826	A	7	7	4104	4110	100 %	0 %	0 %	0 %	525888614
56	NC_021826	TTA	2	6	4122	4127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888614
57	NC_021826	AGA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888614
58	NC_021826	CTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888614
59	NC_021826	TAA	2	6	4181	4186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888614
60	NC_021826	AAG	2	6	4233	4238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888615
61	NC_021826	A	6	6	4242	4247	100 %	0 %	0 %	0 %	525888615
62	NC_021826	CTAA	2	8	4283	4290	50 %	25 %	0 %	25 %	525888615
63	NC_021826	AATA	2	8	4291	4298	75 %	25 %	0 %	0 %	525888615
64	NC_021826	ATT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888615
65	NC_021826	AAT	2	6	4385	4390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
66	NC_021826	TAAT	2	8	4491	4498	50 %	50 %	0 %	0 %	525888615
67	NC_021826	TAA	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
68	NC_021826	AAT	2	6	4526	4531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
69	NC_021826	TAT	2	6	4609	4614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888615
70	NC_021826	ATA	2	6	4636	4641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888615
71	NC_021826	AAT	2	6	4749	4754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888616
72	NC_021826	TTAA	2	8	4788	4795	50 %	50 %	0 %	0 %	525888616
73	NC_021826	TTA	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888616
74	NC_021826	TTA	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888616
75	NC_021826	TTC	2	6	4885	4890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525888616
76	NC_021826	AAT	2	6	4971	4976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525888616
77	NC_021826	CTTA	2	8	5000	5007	25 %	50 %	0 %	25 %	525888616
78	NC_021826	TAT	2	6	5144	5149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888616
79	NC_021826	A	6	6	5150	5155	100 %	0 %	0 %	0 %	525888616
80	NC_021826	A	7	7	5166	5172	100 %	0 %	0 %	0 %	525888616
81	NC_021826	AGA	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525888617
82	NC_021826	T	7	7	5306	5312	0 %	100 %	0 %	0 %	525888617
83	NC_021826	TGA	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888617
84	NC_021826	ATG	2	6	5378	5383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888617
85	NC_021826	T	6	6	5394	5399	0 %	100 %	0 %	0 %	525888617
86	NC_021826	TGA	2	6	5409	5414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888617
87	NC_021826	AGT	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525888617
88	NC_021826	TA	3	6	5615	5620	50 %	50 %	0 %	0 %	525888617
89	NC_021826	ATTT	2	8	6071	6078	25 %	75 %	0 %	0 %	525888618
90	NC_021826	ATC	2	6	6086	6091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888618
91	NC_021826	ACA	2	6	6104	6109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525888618
92	NC_021826	TAT	2	6	6189	6194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525888618
93	NC_021826	TA	3	6	6200	6205	50 %	50 %	0 %	0 %	525888618
94	NC_021826	TGGG	2	8	6206	6213	0 %	25 %	75 %	0 %	525888618
95	NC_021826	G	7	7	6211	6217	0 %	0 %	100 %	0 %	525888618
96	NC_021826	AAAC	2	8	6228	6235	75 %	0 %	0 %	25 %	525888618
97	NC_021826	TAC	2	6	6280	6285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525888618
98	NC_021826	AT	3	6	6292	6297	50 %	50 %	0 %	0 %	525888618
99	NC_021826	CGG	2	6	6322	6327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525888618
100	NC_021826	A	6	6	6359	6364	100 %	0 %	0 %	0 %	525888618
101	NC_021826	TAAA	2	8	6395	6402	75 %	25 %	0 %	0 %	525886095
102	NC_021826	T	6	6	6471	6476	0 %	100 %	0 %	0 %	525886095
103	NC_021826	GTT	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886095
104	NC_021826	CGAG	2	8	6584	6591	25 %	0 %	50 %	25 %	525886095
105	NC_021826	TGT	2	6	6605	6610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886095
106	NC_021826	TGG	2	6	6689	6694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886095
107	NC_021826	TGAA	2	8	6698	6705	50 %	25 %	25 %	0 %	525886095
108	NC_021826	AAAATG	2	12	6707	6718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525886095
109	NC_021826	TCT	2	6	6754	6759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886095
110	NC_021826	TTC	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525886095
111	NC_021826	GA	3	6	6818	6823	50 %	0 %	50 %	0 %	525886095
112	NC_021826	AAT	2	6	6872	6877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525886096
113	NC_021826	GAA	2	6	6882	6887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525886096
114	NC_021826	ACAAA	2	10	6890	6899	80 %	0 %	0 %	20 %	525886096
115	NC_021826	GAA	2	6	6962	6967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525886096
116	NC_021826	TTG	2	6	6991	6996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886096
117	NC_021826	TGA	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886096
118	NC_021826	T	6	6	7058	7063	0 %	100 %	0 %	0 %	525886096
119	NC_021826	TTG	2	6	7069	7074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886096
120	NC_021826	TGA	3	9	7079	7087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886096
121	NC_021826	GCT	2	6	7170	7175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525886096
122	NC_021826	GTG	2	6	7190	7195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525886096
123	NC_021826	TAAA	2	8	7204	7211	75 %	25 %	0 %	0 %	525886096
124	NC_021826	ATT	2	6	7255	7260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525886096
125	NC_021826	AAGAA	2	10	7265	7274	80 %	0 %	20 %	0 %	525886096
126	NC_021826	TAAG	2	8	7330	7337	50 %	25 %	25 %	0 %	525886097
127	NC_021826	CTA	2	6	7344	7349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525886097
128	NC_021826	CAA	2	6	7374	7379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525886097
129	NC_021826	TGA	2	6	7383	7388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525886097
130	NC_021826	TCTT	2	8	7463	7470	0 %	75 %	0 %	25 %	525886097
131	NC_021826	CTG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525886097
132	NC_021826	T	6	6	7626	7631	0 %	100 %	0 %	0 %	525886097
133	NC_021826	TTTG	2	8	7644	7651	0 %	75 %	25 %	0 %	525886097
134	NC_021826	GTTTT	2	10	7664	7673	0 %	80 %	20 %	0 %	525886097
135	NC_021826	TGT	2	6	7706	7711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886097
136	NC_021826	GCTT	2	8	7712	7719	0 %	50 %	25 %	25 %	525886097
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138	NC_021826	GTT	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525886097
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263	NC_021826	T	7	7	13557	13563	0 %	100 %	0 %	0 %	525886102
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